O produtor da série The Legend of Zelda, Eiji Aonuma, reconheceu em 2005 que a sensação de incompletude em The Wind Waker foi culpa dele, explicando que o jogo precisou ser reduzido para ser concluído a tempo. Ele comentou isso em entrevista concedida antes do lançamento de Twilight Princess.
Na época, Aonuma explicou que o plano original era um jogo maior, mas o desenvolvimento exigiu uma versão mais compacta para respeitar os prazos. Apesar da redução de conteúdo, ele afirmou que a equipe se esforçou para garantir que a experiência fosse suficiente para os jogadores. Ainda assim, ele admitiu que a impressão de que o jogo estava incompleto foi uma consequência de sua falta de empenho.
O lançamento da versão remasterizada de The Wind Waker para Wii U trouxe o título para uma nova geração de fãs e corrigiu algumas das críticas originais, contribuindo para sua valorização. Inicialmente criticado pelo estilo visual cartunesco, que destoava da expectativa por um “próximo Zelda de nova geração”, o jogo é hoje considerado um favorito entre os fãs.
A edição Wii U não apenas melhorou aspectos técnicos, mas também ressaltou a qualidade do título que, apesar das críticas na época, teve boa recepção da crítica especializada. Há ainda especulações entre fãs de que as dungeons cortadas no desenvolvimento original possam ter servido de base para paisagens e desafios de jogos subsequentes da série.
Aonuma deixou claro que para futuras entregas de The Legend of Zelda espera evitar a impressão de incompletude que ocorreu em The Wind Waker. Isso mostra um compromisso da equipe em entregar jogos mais robustos e completos, o que é uma expectativa natural dos fãs para os próximos lançamentos da franquia.


